L'architecture génétique élucidée
Les gènes agissent-ils de manière plus ou moins indépendante ou existent-ils des interactions complexes, responsables de réponses systématiques, encore inconnues des scientifiques ? Jusqu'à présent, les scientifiques pensaient que les gènes agissaient dans une large mesure de manière indépendante, bien que la biologie moléculaire ait démontré l'existence de réseaux génétiques complexes dont l'organisation reste encore mystérieuse. Dernièrement, des recherches récentes qui ne peuvent être ignorées ont révélé des résultats surprenants sur l'architecture génétique. Le projet STSGA («Statistical Tools for studying genetic architecture»), financé par l'UE, a entre autres étudié ces hypothèses par des expériences statistiques en cherchant à améliorer les méthodes conventionnelles. Ces expériences apparaissent fondamentales pour répondre à certaines questions cruciales de la biologie, de l'évolution des espèces à la variation des populations, en passant par l'amélioration des espèces d'élevage ou des cultures végétales. Elles permettront également de prédire les limites de la sélection artificielle et d'en éviter les effets secondaires indésirables. Pour atteindre ses objectifs et mieux comprendre l'architecture génétique, le projet a analysé les paramètres dynamiques pertinents en combinant les modèles statistiques avec des modèles basés sur les processus. Les chercheurs ont également étudié la valeur de certains traits dans les générations successives de populations soumises à une sélection artificielle contrôlée. Les membres du projet ont ensuite analysé les données des loci de caractères quantitatifs (QTL) obtenues par cartographie. Ces données contiennent des informations sur les marqueurs moléculaires qui, associées à certaines différences bien spécifiques le long du génome, permettent de comprendre comment celles-ci affectent certains traits ou caractères. Le projet STSGA a réussi à développer un logiciel capable de détecter des interactions génétiques (épistasie) susceptibles d'avoir des implications profondes sur l'évolution des espèces. L'équipe du projet a utilisé cette information pour analyser les QTL responsables de la taille des os ou des organes internes chez la souris, démontrant ainsi l'existence de profils d'interactions génétiques. Les chercheurs ont également élaboré un cadre statistique modèle permettant d'estimer l'architecture génétique à partir des réponses de la sélection artificielle, ce qui permettrait de caractériser les différentes architectures génétiques. Cette méthode est également incorporée dans un nouveau logiciel, rendant ainsi les futures recherches dans cette direction plus faciles et plus exhaustives. En résumé, ces résultats et les logiciels développés vont peut-être permettre d'accélérer la recherche dans ce domaine dans les années à venir et permettre aux chercheurs d'expliquer l'architecture génétique avec beaucoup plus de précision. La recherche médicale et les recherches sur le vieillissement en seront probablement profondément modifiées.
