Nuevo atlas de la expresión génica en ratones
Unos científicos financiados por la Unión Europea han creado un atlas de la expresión génica en el desarrollo embrionario del ratón, consolidando de este modo los conocimientos científicos acerca de la importancia de la transcripción génica. Los resultados de este estudio, publicados en la revista PLoS Biology, aportarán la información necesaria para determinar qué genes se coexpresan y para identificar vínculos entre genes que desempeñan un papel importante tanto en el desarrollo como en las enfermedades. El estudio se financió en parte a través del proyecto EUREXPRESS («Consorcio europeo para la creación en internet de un atlas de expresión génica mediante hibridación in situ de ARN»), dotado con 11 millones de euros provenientes del Área temática «Ciencias de la vida, genómica y biotecnología aplicadas a la salud» del Sexto Programa Marco (6PM) de la UE. EUREXPRESS obtuvo datos acerca de la expresión de más de veinte mil genes mediante hibridación in situ de ARN en cortes sagitales de embriones de ratón. Investigadores coordinados por el Instituto Telethon de Genética y Medicina (TIGEM), en Italia, incluyeron en este estudio datos sobre la expresión de más de dieciocho mil genes codificantes en cientos de estructuras anatómicas, generando un atlas de expresión génica exhaustivo e interactivo, en formato abierto y digital. Se han logrado identificar redes de regulación génica tanto específicas de tejido como comunes a diferentes tejidos. La información obtenida aporta una nueva perspectiva sobre el desarrollo de diversas estructuras, entre las que se incluye el telencéfalo, una amplia región del cerebro a la que se le atribuyen varias funciones, entre ellas la motora. El equipo ha estudiado con éxito la correlación de fenotipos patológicos con los sitios de expresión de genes concretos, y ha obtenido información que ayudará a comprender la compleja organización segmentaria del cerebro de los mamíferos. La resolución celular del atlas creado por EUREXPRESS ha permitido al equipo investigador identificar marcadores genéticos que caracterizan la subdivisión molecular de los órganos, así como nuevos marcadores putativos de linaje hematopoyético. Esta obra también facilitará el estudio exhaustivo en todo el organismo de una vía de señalización clave en el desarrollo. «Gracias a su calidad y resolución, los datos obtenidos han desvelado nuevos aspectos moleculares del desarrollo de diversas estructuras, como el telencéfalo; han permitido identificar un nuevo nivel de organización del hipotálamo; y han permitido un conocimiento más preciso de la vía de señalización Wnt, implicada en la diferenciación del epitelio renal durante el desarrollo del riñón», señalan los autores. Tal y como ha explicado el profesor del TIGEM Andrea Ballabio, «este trabajo solo ha sido posible gracias a la estrecha colaboración entre todos los científicos implicados, y es un bonito ejemplo de lo que se puede lograr mediante un esfuerzo coordinado y cooperativo. El atlas de expresión génica supondrá una herramienta clave para descubrir nuevas funciones de genes y mecanismos de enfermedades.» Acerca del esfuerzo coordinado que ha supuesto este estudio, el profesor Stylianos E. Antonarakis de la Universidad de Ginebra (Suiza), coautor del trabajo, ha declarado: «La magnitud de este trabajo hacía necesario formar un equipo de especialistas cuyas habilidades combinadas permitiesen alcanzar un objetivo que es mayor que la suma de sus partes. Los datos (disponibles de manera gratuita) y las excelentes imágenes serán de gran ayuda para todos aquellos investigadores que estudian la función del genoma y las causas moleculares de la gran cantidad de alteraciones genéticas existentes.» Tal y como han señalado los científicos, la investigación genómica ha impulsado el conocimiento de los procesos fisiológicos y fisiopatológicos, desde las enfermedades infecciosas hasta el cáncer. La obtención de gran cantidad de datos y la integración de la información que contienen son aspectos fundamentales de este enfoque, según han explicado. «Determinar dónde y cuándo se expresan los genes tiene una importancia crucial para comprender o predecir el papel fisiológico de genes y proteínas, y determinar cómo interaccionan para dar lugar a las complejas redes que regulan la función y el desarrollo de los órganos», escriben los autores. «El progreso en la comprensión de las redes de regulación génica requiere el empleo de amplios abordajes paralelos que estudien la complejidad de las redes de forma global.» En el futuro, estos datos podrán emplearse para identificar diferencias regionales difíciles de detectar en órganos estructuralmente complejos, así como firmas de expresión de poblaciones celulares concretas. A este estudio han contribuido expertos de Francia, Alemania, Italia, España, Suiza y Reino Unido.Para más información, consulte: EUREXPRESS: http://www.eurexpress.org Instituto Telethon de Genética y Medicina (TIGEM): http://www.tigem.it/ PLoS Biology: http://www.plosbiology.org/home.action Si desea leer el artículo íntegro en PLoS Biology, consulte: aquí
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