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A Systems Biology approach to disclose auxin synthesis in plants

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Comment construire une plante

Les plantes peuvent survivre face à de nombreuses menaces extérieures grâce à leur structure et leur chimie, mais on manque de connaissances concernant la synthèse de l'auxine, une phytohormone. Des chercheurs ont eu recours à l'analyse des systèmes pour combler ces lacunes.

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Les végétaux ont développé une flexibilité de développement qui leur permet de modeler leur forme et leur métabolisme pour survivre dans des environnements souvent hostiles. L'une de ces réponses consiste à contrôler la forme de la plante grâce à une phytohormone, l'auxine. Au cours des dernières décennies, la compréhension de l'action et de la signalisation de l'auxine a beaucoup progressé. Par contraste, la synthèse de l'auxine n'est pas encore complètement définie en termes de réactions et d'enzymes impliqués. L'initiative SYSBIOAUX (A systems biology approach to disclose auxin synthesis in plants), financée par l'UE, avait pour objectif de trouver les chemins par lesquels l'auxine est synthétisée dans les végétaux. Les chercheurs ont utilisé une approche de biologie des systèmes basée sur la plante modèle Arabidopsis thaliana. Le projet SYSBIOAUX a étudié le parasitage entre les voies particulières dont on pense qu'elles créent et régulent l'auxine dans les végétaux. Les chercheurs ont utilisé la génomique, la transcriptomique et la métabolomique sur la plante modèle Arabidopsis thaliana pour comprendre ce processus. L'équipe du projet a pu obtenir des informations sur le contrôle génétique de la synthèse de l'auxine. Après des études transcriptomiques et métaboliques supplémentaires, ils ont créé un modèle de réseau de réactions qui produit de l'auxine. Le projet SYSBIOAUX a permis d'établir un lien entre la synthèse de l'auxine et les réponses des plantes au stress, comblant ainsi de vieilles lacunes dans nos connaissances sur la manière dont les plantes croissent.

Mots‑clés

Plantes, auxine, phytohormone, SYSBIOAUX, biologie des systèmes, synthèse d'auxine

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