Opis projektu
Analiza mikrobiomu gąbek mezofotycznych
Większość drobnych cząsteczek dopuszczonych obecnie do zastosowań biomedycznych zainspirowana jest produktami naturalnymi. Środowisko morskie jest sprawdzonym źródłem potencjalnych nowych cząsteczek bioaktywnych, jednak ze względu na trudności techniczne w dotarciu do znajdującej się na głębokości od 30 do 150 metrów pod taflą wody i pogrążonej w półmroku strefy mezofotycznej, jest ona słabo zbadana. To w znacznym stopniu uniemożliwiło zbadanie potencjału gąbek mezofotycznych jako produktów naturalnych. Celem finansowanego ze środków UE projektu COSMos jest bliższe przyjrzenie się metagenomom gąbek mezofotycznych. W celu zbadania potencjału ośmiu głównych gatunków gąbek mezofotycznych w roli produktów naturalnych, które doprowadzić ma do odkrycia nowych cząsteczek o potencjale leczniczym, w ramach badania połączone zostaną analizy dużych zbiorów danych, metody z zakresu biologii molekularnej i syntetycznej oraz bioinformatyki.
Cel
Molecules made by nature, or natural products, inspire the majority of currently approved small molecules for use in medicine. With an increase in widespread antibiotic resistance and the perpetual search for anticancer drugs, new sources of natural products must be discovered. The marine environment is a proven, prolific source of novel bioactive molecules and much of the ocean remains chemically and genetically unexplored. The mesophotic zone is particularly neglected because of the technological difficulty of reaching this twilight zone of the ocean. Shallow water marine sponges have been well documented to have diverse microbial populations and impressive chemical repertoires. Mesophotic sponges, however, are relatively unstudied in terms of their natural product potential. This project aims to take a deep dive into the metagenomes of mesophotic sponges for their natural product potential. Hybrid sequencing and assembly of metagenomes of eight prioritized sponges will uncover new biosynthetic gene clusters for heterologous expression and chemical elucidation. This study will combine large data analyses, cutting edge molecular and synthetic biology approaches and bioinformatic techniques to survey the natural product potential of mesophotic sponges and discover new molecules with medicinal potential.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczeinformatykanauka o danych
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiologia syntetyczna
- nauki przyrodniczenauki biologicznemikrobiologia
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznafarmakologia i farmacjaoporność na lekioporność na antybiotyki
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Koordynator
6708 PB Wageningen
Niderlandy