Opis projektu
Międzynarodowa oparta na chmurze platforma do analizy danych dotyczących chorób zakaźnych
Badania przeprowadzone z udziałem pacjentów cierpiących na choroby zakaźne dostarczyły ogromnej ilości danych klinicznych, epidemiologicznych i omicznych. Nie istnieje jednak uniwersalny sposób ich przechowywania i analizy. Zespół finansowanego przez UE projektu RECODID stworzy wspólne oparte na chmurze repozytorium przeznaczone do przechowywania i wymiany informacji, z którego korzystać będą mogły społeczności naukowe na całym świecie. Platforma zapewni narzędzia analityczne umożliwiające wydajną, wielodziedzinową i opartą na współpracy analizę danych klinicznych i laboratoryjnych przy jednoczesnym zachowaniu wszystkich wytycznych dotyczących zasad etycznych i zarządzania. Co ważne, dostarczy także dowodów, które nadadzą kierunek rozwojowi diagnostyki i leczenia chorób zakaźnych.
Cel
ReCoDID builds on existing infrastructures and partnerships to develop a sustainable model for the storage, curation, and analyses of the complex data sets collected by infectious disease (ID)-related cohorts. While ID cohorts collect both clinical-epidemiological (CE) and terabytes of OMICS data, storage and analysis of CE and high dimensional laboratory (HDL) data remains separate and developing the infrastructure for housing and analysing HDL data is not feasible for individual studies. In this project, we develop innovative approaches to the synthesis and analysis of CE&HDL data, and modify governance models for cloud-based repositories elaborated by and for scientists in high-income countries to meet the specific challenges of synthesizing CE&HDL data and sharing data across international cohorts and with the Open Science community. We develop data architecture and governance that link biobanks to data repositories to facilitate equitable use, collaborative, cross-domain analyses, and replicability. The team leverages partnerships with multicentre ID cohorts in the global South, and connects EU investments in OMICS infrastructures with Canadian expertise on pipeline and workflow development, biostatistical methods, and ethical and governance issues related to the establishment of repositories for CE&HDL data in resource-limited settings. Drawing from best practice and governance elaborated for similar initiatives, the repository will employ a federated model where a tiered permission system and cohort-specific hubs facilitate cohorts’ analysis of their own data, cross-cohort analyses, and connections with the open science community within a clearly elaborated legal, ethical, and equitable framework. The cloud-based platform will provide analytic tools and computational power to facilitate cross-domain, collaborative analyses that inform personalized medicine approaches to diagnostic, treatment, and vaccine development in ID-focused international cohorts.
Dziedzina nauki
Not validated
Not validated
Słowa kluczowe
Program(-y)
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSzczegółowe działanie
H2020-SC1-2018-Single-Stage-RTD
System finansowania
RIA - Research and Innovation actionKoordynator
69120 Heidelberg
Niemcy