Wyniki badania zwracają uwagę na zróżnicowanie genomów
Nowe badanie niemieckich i amerykańskich naukowców zwraca uwagę na duże zróżnicowanie genomów u osobników tego samego gatunku. Ze względu na łatwość uprawy i krótki cykl rozwojowy roślina o nazwie Arabidopsis thaliana (rzodkiewnik) jest od lat wykorzystywana przez biologów do badania podstaw botaniki. Posiada ponadto stosunkowo mały genom, który został zsekwencjonowany w 2000 r. Jednak A. thaliana występująca w naturze bardzo różni się od odmiany powszechnie uprawianej w laboratoriach. W czasopiśmie "Science" naukowcy wyjaśnili, w jaki sposób analizowali genomy 20 różnych odmian A. thaliana oraz badali, które geny były takie same w przypadku całego gatunku, a które najbardziej się różniły. - Stwierdziliśmy, że jeden na 10 genów jest zdecydowanie różny - powiedział Detlef Weigel z Instytutu Biologii Rozwojowej Maksa Plancka. - Ta plastyczność jest w istocie zaskakująca w przypadku genomu, który jest bardzo uproszczony i w przeciwieństwie do większych genomów nie zawiera dużej ilości "śmieciowego" DNA. Badanie wskazało, że geny odpowiedzialne za podstawowe funkcje komórkowe, takie jak produkcja białka lub regulacja genów, wykazują małe zróżnicowanie. Natomiast geny zaangażowane w regulowanie interakcji rośliny ze środowiskiem i innymi organizmami są wysoce zróżnicowane. Są to geny, które pomagają roślinie na przykład zwalczać patogeny lub radzić sobie z nadmiarem ciepła lub suszą. - Zróżnicowanie genetyczne zdaje się odzwierciedlać dostosowanie do lokalnych warunków - wyjaśnia profesor Weigel. - Rozszerzając tego typu badania na inne gatunki mamy nadzieje pomóc hodowcom stworzyć odmiany, które będą optymalnie dostosowane do gwałtownie zmieniających się warunków środowiskowych. Profesor Weigel już współpracuje z Międzynarodowym Instytutem Badań Ryżu (IRRI) na Filipinach, aby wykorzystać metody stosowane w przypadku Arabidopsis dla 20 odmian ryżu. W związku z badaniem pojawiają się również pytania dotyczące wartości modelowych sekwencji genomu. - Nie istnieje coś takiego jak genom gatunku - dodaje profesor Weigel. - Fakt, że sekwencja DNA pojedynczego osobnika zdecydowanie nie jest wystarczająca do zrozumienia genetycznego potencjału gatunku, również zachęca do podejmowania wysiłków badawczych w dziedzinie genetyki człowieka.
Kraje
Niemcy, Stany Zjednoczone